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完全長cDNA libraryを作成するためには、大多数を占める不完全長cDNAから
完全長cDNAを選別する過程が必須である。完全長cDNAを選別するためには
その5'端・3'端の両方が識別できればよい。すなわち、完全長cDNA libraryの構築とは
cDNA両端の選別に同義である。
mRNAの3'端にはpolyA配列という明確な選別対象が存在する。
事実、従来のcDNA libraryの作成方法においてもこの3'端特徴的構造(tag)は、
dTプライマーを用いて第一鎖cDNA合成を行うことにより選択過程に用いられている。
これに対しmRNAの5'端に天然に存在するキャップ構造は、このままでは選別に利用するには不適である。
そこで我々はキャップ構造をpolyA配列のように 塩基配列上の特異構造(sequence tag)に
変換することができればその利用は容易であると考えた。
すなわちキャップ構造を選択的にsequence tagに置換する方法、
オリゴキャッピング法を用いればmRNAの5'端の選別が可能である。
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